Det meste kan klares med sol, regn, frost og blæst.
Hvad du ellers kan gøre afhænger også af om de fx går på jord, sand eller halm og hvordan din grund i øvrigt ser ud.
Men du kan fjerne det øverste lag jord/møg en gang imellem og sprede et nyt lag jord eller halm. Det du har fjernet kan så bruges i kompostbunken/haven eller blot komme tilbage i hønsegården et halvt år senere.
Lidt kalk kan måske godt hjælpe med at jorden ikke bliver for sur, men jeg tror ikke det er egnet som egentlig desinfektion i en hønsegård.
Du kan også dele gården op i 2 som bruges skiftevis, hvis den er stor nok.